“Multidisipliner Moleküler Teknikler ve Biyoinformatik Eğitimler Serisi I”PCR, Sekanslama ve Biyoinformatik Uygulamalı ve Teorik Kurs Kayıtları Başladı !
“Multidisipliner Moleküler Teknikler ve Biyoinformatik Eğitimler Serisi I”PCR, Sekanslama ve Biyoinformatik Uygulamalı ve Teorik Kurs Kayıtları Başladı !
Tarih: 17-19 Şubat 2025
Saat: 09:00
Süre: 3 gün (Teorik ve Uygulamalı Eğitim)
Yer: Ondokuz Mayıs Üniversitesi Karadeniz İleri Teknoloji Araştırma ve Uygulama Merkezi (KİTAM) Biyoteknoloji Laboratuvarı
Katılım Talep Formu İçin Tıklayınız!
Kursun Amacı
• Moleküler teknikler ve biyoinformatik alanında multidisipliner yaklaşımla teorik bilgi ve pratik deneyim kazandırmak
Kurs İçeriği
1. Nükleik asit izolasyonu
• Bakteri, bitki, hayvansal kan ve dokudan DNA izolasyonu
• Manuel DNA izolasyonu
• KİT aracılı DNA izolasyonu
• DNA kalite ve miktar tayini
2. Primer Tasarımı ve PCR
• Veri tabanlarından genom bilgisinin elde edilmesi
• Primer tasarımı ve kalite parametreleri
• Temel PCR teknikleri (Standart, Rt-qPCR, Multiplex PCR) ve optimizasyon
• Reaksiyon kurulumu ve thermalcycler
3. Jel elektroforez
• PCR ürünlerinin hazırlanması
• Jel elektroforezin hazırlanması
• PCR ürünlerinin yüklenmesi, görüntülenmesi ve analizi
4. Sanger Sekanslama ve biyoinformatik
• PCR ürünlerinin saflaştırılması
• Sanger sekanslama ile DNA dizilerinin belirlenmesi
• DNA dizilerinin MEGA ile biyoinformatik analizi
• DNA dizilerinin hizalanması ve polimorfizimlerin belirlenmesi
• Dizilerin filogenetik ilişkilerinin belirlenmesi
5. Yeni Nesil Dizileme Analizi ve Biyoinformatik Algoritmalar
• Yeni Nesil Dizileme Teknolojisi
• Primer ve Sekonder Analiz (FastqVcf)
• Tersiyer Analiz (Varyant Analizi)
Eğitmenler:
Doç. Dr. Kubilay YILDIRIM – Eğitim Koordinatörü (Fen Fakültesi, Moleküler Biyoloji ve Genetik AD.)
Dr. Eda UĞURTAY – Laboratuvar Koordinatörü (KİTAM, Biyoteknoloji Birimi)
Prof Dr. Sezgin GÜNEŞ (Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji AD.)
Doç. Dr. Serbülent YİĞİT (Veteriner Fakültesi, Veteriner Genetiği AD.)
Doç. Dr. Şengül TURAL (Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji AD.)
Doç. Dr. Sercan ERGÜN (Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji AD.)
Dr. Öğr. Üyesi Ümmet ABUR (Tıp Fakültesi, Tıbbi Genetik AD.)
Dr. Öğr. Üyesi Ömer Salih AKAR (Tıp Fakültesi, Tıbbi Genetik AD.)
Dr. Eda UĞURTAY – Laboratuvar Koordinatörü (KİTAM, Biyoteknoloji Birimi)
Dr. Hilal KOYUNCU (Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji AD.)
Dr. Tuğba KESKİN (Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji AD.)
Organizasyon Komitesi: Ondokuz Mayıs Üniversitesi Teknoloji Transfer Ofisi A.Ş.
Prof. Dr. Burcu ONUK,
Doç. Dr. Fatih ÇALIŞKAN,
İrem KÖSE
Kurs Katılımcı sayısı: 15 kişi ile sınırlıdır.
ERKEN KAYIT AVANTAJI !
25 Ocak tarihine kadar Geçerli Kurs Kayıt Ücreti: 5000 tl
* Sonrası 6000 tl olarak ücretlendirilecektir.
Kesin Kayıt: Kayıt ücreti yatırılıp dekontun info@omutto.com email olarak gönderilmesi sonrası kesin kayıt işlemi gerçekleştirilecektir.
Son Kayıt Tarihi: 10.02.2025
Kayıt Ücretine Dahil olan Hizmetler:
• 3 günlük uygulamalı ve teorik eğitimlere katılım
• Çay-kahve, aperatif yiyecek ve meyve ikramları
* Program dahilinde yemek hizmeti bulunmamaktadır.
Kayıt Ücretinin Yatırılacağı Hesap Bilgileri:
Ondokuz Mayıs Üniversitesi Teknoloji Transfer Ofisi A.Ş.
– Vergi Kimlik No: 6430650115 / Gaziler V.D.
– Garanti Bankası Samsun Şubesi
– Şube Kodu: 190
– Hesap No: 6289198
– IBAN No: TR59 0006 2000 1900 0006 2856 67
Sekreterya:
Handan ÇELİK
İletişim: +90 552 032 06 50
| OMU KİTAM BİYOTEKNOLOJİ LABORATUVARI | |||
| 17.02.2025 (1. gün) | |||
| 08:30-09:00 | KAYIT VE TANIŞMA | ||
| 09.00-09.45 | MANUEL VE HAZIR KİTLER İLE DNA İZOLASYON YÖNTEMLERİ – Teorik ders(Doç.Dr. Şengül Tural) | ||
| 09.45-10.00 | KAHVE ARASI | ||
| 10.00-1045 | DNA KALİTE VE MİKTAR TAYİNİ, OLASI SORUNLAR VE ÇÖZÜM ÖNERİLERİ – Teorik ders(Prof Dr. Sezgin Güneş) | ||
| 10.45-11.00 | KAHVE ARASI | ||
| 11.00-12.00 | MANUEL VE KİT İLE DNA İZOLASYON PROTOKOLLERİ– Teorik ders(Dr.Eda Uğurtay) | ||
| 12:00-13:00 | YEMEK | ||
| 13.00-17.00 | MANUEL DNA İZOLASYON PROTOKOLÜNÜN UYGULANMASI -Uygulama(Dr.Eda Uğurtay, Dr. Hilal Koyuncu) | ||
| KİT İLE DNA İZOLASYON PROTOKOLÜNÜN UYGULANMASI – Uygulama (Dr.Eda Uğurtay, Dr. Tuğba Keskin) | |||
| DNA’NIN ELDE EDİLMESİ KALİTE VE MİKTAR TAYİNİ – Uygulama (Dr.Eda Uğurtay) | |||
| 18.02.2025 (2. gün) | |||
| 09.00-09.45 | DNA’NIN YAPISAL ÖZELLİKLERİ VE PCR REAKSİYONU – Teorik ders (Doç.Dr. Serbülent Yiğit) | ||
| 09.45-10.00 | KAHVE ARASI | ||
| 10.00-10.45 | BİYOİNFORMATİK VERI TABANLARI VE PRİMER TASARIMI –Teorik ders(Doç.Dr.Kubilay Yıldırım) | ||
| 10.45-11.00 | KAHVE ARASI | ||
| 11.00-12.00 | JEL ELEKTROFOREZİ VE OLASI SORUNLAR-ÇÖZÜM ÖNERİLERİ– Teorik ders(Doç.Dr. Serbülent Yiğit) | ||
| 12:00-13:00 | YEMEK | ||
| 13.00-17.00 | PCR REAKSİYONUNUN KURULMASI -Uygulama (Dr.Eda Uğurtay) | ||
| PCR ÇEŞİTLERİ VE KULLANIM ALANLARI – Teorik(Doç.Dr. Sercan Ergün) | |||
| SANGER VE YENİ NESİL DİZİLEME Teorik ders(Doç.Dr.Kubilay Yıldırım) | |||
| JEL ELEKTROFOREZİ VE GÖRÜNTÜLEME -Uygulama(Dr.Eda Uğurtay) | |||
| PCR ÜRÜNLERİNİN SAFLAŞTIRILMASI – Uygulama(Dr.Eda Uğurtay) | |||
| 19.02.2025 (3. gün) | |||
| 09.00-09.45 | SANGER DİZİLEME VE KALİTE PAREMETRELERİ – Uygulama(Dr.Eda Uğurtay) | ||
| 09.45-10.00 | KAHVE ARASI | ||
| 10.00-10.45 | MEGA İLE DİZİ ANALİZİ, HİZALAMA, FİLOGENİ ANALİZİ – Uygulama(Doç.Dr.Kubilay Yıldırım) | ||
| 10.45-11.00 | KAHVE ARASI | ||
| 11.00-12.00 | YENİ NESİL DİZİLEME TEKNOLOJİSİ – Teorik Ders (Doç.Dr.Kubilay Yıldırım) | ||
| YEMEK | |||
| 13.00-13:45 | BİYOİNFORMATİK ALGORİTMALAR- Uygulama(Dr.Öğr.Üyesi Ömer Salih Akar) | ||
| 13.45-14.00 | KAHVE ARASI | ||
| 14.00-14.45 | PRİMER VE SEKONDER ANALİZ (FASTQàVCF) – Uygulama(Dr.Öğr.Üyesi Ömer Salih Akar) | ||
| 14.45-15.00 | KAHVE ARASI | ||
| 15.00-16-45 | BİYOİNFORMATİK ALGORİTMALAR-TERSİYER ANALİZ (VARYANT ANALİZİ) – Uygulama(Öğr.Üyesi Ümmet Abur) | ||
| 17.00 | KAPANIŞ | ||
